تصنيف الفيروسات Classification of Viruses

نظام تصنيف للفيروسات مشابه لتصنيف الكائنات الحيّة الأخرى كانت بدايته بطيئة، جزئيا لأنه لا تتوفر بيانات كافية دائماً لتحديد كيف ترتبط الفيروسات المختلفة ببعضها البعض.

التسمية الفيروسية Viral nomenclature إستخدمت مجموعة متنوعة من الإتفاقيات conventions. على سبيل المثال:

أ- فيروسات سمّيت على اسم المرض الذي تسببه، مثل فيروس الحصبة measles virus وفيروسات الجدري poxviruses.

ب- فيروسات سمّيت على اسم الموقع الذي عزلت منه أصلاً، مثل فيروسات إيبولا وماربورج Ebola and Marburg viruses.

ج- فيروسات سمّيت على اسم الباحثين الذين درساه، مثل فيروس إبشتاين بار Epstein-Barr virus.

د- الفيروسات الأخرى سمّيت على عوامل مورفولوجية، الفيروسات التاجية (فيروسات الكورونا) coronaviruses (corona = "تاج") لها محفظة capsid تشبه التاج وفيروسات البيكورنا picornaviruses (pico = "صغير"؛ rna = "الحمض النووي الريبي RNA") هي فيروسات صغيرة جدا مع مورّث RNA.

نظام تصنيف أكثر شمولية أبتكر من قبل اللجنة الدولية لتصنيف الفيروسات International Committee on Taxonomy of Viruses (ICTV). حتى الآن، الوحدة التصنيفية الأعلى هي الرتبه order (القبائل phyla والأقسام classes) لم يتم تطويرها. في 2008، تم تمييز خمسة رتب تشمل 20 عائلة families، كلّها تنتهي بالخاتمه viridae (مثل:- Herpesviridae؛ Coronaviridae). 64 عائلة أخرى لحدّ الآن لم تخصّص إلى عائلة. الفيروسات صنّفت إلى مئات الأجناس genera؛ كلّ اسم جنس ينتهي بالخاتمة virus (مثل:- Herpesvirus؛ Coronavirus). الأسماء (التسمية الثنائية binomial nomenclature) لحدّ الآن لم يتّفق عليها للأنواع species.

فيروسات من العديد من العوائل المختلفة تسبّب أمراض في البشر. مجموعه من العوائل الفيروسية التي تؤثّر على البشر، بالإضافة إلى بعض خصائصها، موضحة في الجدول أدناه. هذه الفيروسات قسّمت إلى قسمين واسعين بالإستناد على نوع جينومها genome type ونوع الشريط strand type.

1- فيروسات DNA

العديد من الفيروسات تحتوي على جينومات DNA إمّا مفردة الشريط single-stranded (ss) أو مزدوج الشريط double-stranded (ds) والتي تكون خطيّة linear أو مجزأة segmented. الجينومات تتضاعف بواسطة نسخ DNA إلى DNA مباشرة بإستخدام إنزيم بلمرة DNA (DNA polymerase)، والذي يتطلّب أن تتضاعف معظم فيروسات DNA في نواة nucleus خلية العائل. الإستثناء الوحيد هي فيروسات الجدري poxviruses التي تتضاعف في سيتوبلازم cytoplasm العائل، الذي يعني أن هذه الفيروسات يجب أن تحمل جين إنزيم بلمرة DNA الخاص بها.

2- فيروسات RNA

عدد كبير من الفيروسات تحتوي على إمّا جينومات ssRNA أو dsRNA، التي تتضاعف عن طريق نسخ RNA إلى RNA مباشرة. مرة أخرى، الجينومات يمكن أن تكون خطيّة أو مجزأة. البعض من الفيروسات مفردة الشريط، مثل فيروسات البيكورنا picornaviruses وفيروسات الكورونا coronaviruses، جينوم RNA الخاص بها هو على شكل RNA الرسول messenger RNA (mRNA). فيروسات RNA هذه يشار إليها باسم موجبة الشريط positive-strand (+ strand).

فيروسات ssRNA الأخرى، مثل الفيروسات المخاطية orthomyxoviruses وفيروسات النظائر المخاطية paramyxoviruses، لها جينومات RNA تتكون من أشرطة RNA التي ستكون مكمّلة complementary إلى RNA الرسول (mRNA)؛ هذه الجينومات يشار إليها باسم سالبة الشريط (- strand).

بالرغم من أنها عادة تصنف مع فيروسات RNA، الفيروسات القهقرية retroviruses تتضاعف بشكل غير مباشر عبر وسائط DNA (RNA إلى DNA إلى RNA). يحتوي كلّ فيريون virion على نسختين من RNA موجب الشريط. أثناء عملية العدوى, ستشكّل وسائط DNA بإستخدام إنزيم النسخ العكسي reverse transcriptase المحمول داخل الفيريون (إنزيم النسخ العكسي: إنزيم ينسخ RNA مفرد الشريط إلى DNA مزدوج الشريط). كقاعدة، جينومات فيروس RNA أصغر من جينومات فيروس DNA وتعتمد بشدّة على بروتينات وإنزيمات خلية العائل للتضاعف.

جدول: العوائل الرئيسيه للفيروسات البشرية وخصائصها

العائله		نوع الشريط	تماثل المحفظه		فيريون مغلف أو عاري		القطر (نانومتر)	أمثلة الأمراض
فيروسات DNA
فيروسات الجدري Poxviridae	مزدوج			معقد		مغلف	170-300	الجدري Smallpox, جدري القرود monkeypox
فيروسات الهربس Herpesviridae	مزدوج			إيكوزاهيدرالي		مغلف	150-200	القروح الباردة Cold sores، الهربس التناسلي genital herpes، جدري الماء chickenpox، القوباء المنطقية shingles، كثرة الوحيدات mononucleosis
فيروسات الأدينو Adenoviridae	مزدوج			إيكوزاهيدرالي		عاري	70-90	نزلات البرد Common cold، إلتهاب السحايا الفيروسي viral meningitis
فيروسات البابوفا Papovaviridae	مزدوج			إيكوزاهيدرالي		عاري	45-55	الثآليل Warts، الثآليل التناسلية genital warts، سرطان عنق الرحم cervical cancer
الفيروسات الكبدية Hepadnaviridae	مزدوج (w/RNA intermediate)			إيكوزاهيدرالي		مغلف	42	إلتهاب الكبد ب Hepatitis B، سرطان الكبد liver cancer
الفيروسات الصغيرة Parvoviridae	مفرد			إيكوزاهيدرالي		عاري	18-26	المرض الخامس Fifth disease، الإلتهاب المعدي المعوي gastroenteritis
فيروسات RNA
فيروسات الريو Reoviridae	مزدوج			إيكوزاهيدرالي		عاري	60-80	الإلتهاب المعدي المعوي gastroenteritis
فيروسات البيكورنا Picornaviridae	مفرد (+)			إيكوزاهيدرالي		عاري	28-30	شلل الأطفال Polio، بعض نزلات البرد some colds، إلتهاب الكبد أ hepatitis A
الفيروسات الكأسية Caliciviridae	مفرد (+)			إيكوزاهيدرالي		عاري	35-40	الإلتهاب المعدي المعوي gastroenteritis
الفيروسات الطخائية Togaviridae	مفرد (+)			إيكوزاهيدرالي		مغلف	60-70	الحصبة الألمانية Rubella، إلتهاب الدماغ encephalitis
الفيروسات المصفرة Flaviviridae	مفرد (+)			إيكوزاهيدرالي		مغلف	40-50	حمى الصفراء Yellow fever، حمّى الضنك dengue fever، إلتهاب الكبد سي hepatitis C، حمّى النيل الغربي West Nile fever (إلتهاب الدماغ encephalitis)
فيروسات الكورونا Coronaviridae	مفرد (+)			حلزوني		مغلف	80-160	سارس SARA
الفيروسات الخيطية Filoviridae	مفرد (-)			حلزوني		مغلف	80-10.000	حمّى إيبولا وماربورج النزفية Ebola and Marburg hemorrhagic fevers
فيروسات البونيا Bunyaviridae	مفرد (-)			حلزوني		مغلف	90-120	متلازمة فيروس هانتا الرئوية Hantavirus pulmonary syndrome
الفيروسات المخاطية Orthomyxoviridae	مفرد (-)			حلزوني		مغلف	90-120	الإنفلونزا Influenza
فيروسات النظائر المخاطية Paramyxoviridae	مفرد (-)			حلزوني		مغلف	150-300	النكاف Mumps، الحصبة measles
الفيروسات الربدية Rhabdoviridae	مفرد (-)			حلزوني		مغلف	70-380	داء السعار Rabies
الفيروسات الرملية Arenaviridae	مفرد (-)			حلزوني		مغلف	50-300	حمّى لاسا Lassa fever
الفيروسات القهقرية Retroviridae	مفرد (+) (w/RNA intermediate)			إيكوزاهيدرالي		مغلف	80-130	الأيدز AIDS، لوكيميا الخلايا التائية في البشر البالغين human adult T-cell leukemia