الأربعاء، 31 يناير 2018

تضاعف DNA




قدم بحث واطسون Watson وكريك Crick عام 1953 حول تركيب DNA لمحة عن كيفية نسخ DNA. خلصوا إلى: "إنه لم يغب عن اذهاننا أن الاقتران المحدد الذي افترضناه يقترح على الفور آلية نسخ copying mechanism محتملة للمادة الوراثية genetic material". في الواقع، نسخ المادة الوراثية، يسمى تضاعف DNA، يحدث بدقة لدرجة أن الخليتين البنويتين two daughter cells المنتجة من الانقسام الثنائي binary fission هي متطابقة وراثياً genetically identical مع الخلية الأبوية parent cell.
معظم البروتينات الأركية archaeal proteins المشاركة في تضاعف DNA هي أكثر تشابها في التسلسل sequence لتلك الموجودة في الخلايا حقيقية النواة eukaryotic cells من بروتينات التضاعف المناظرة analogous replication proteins في الخلايا البكتيرية. أجهزة تضاعف DNA الأركية archaeal DNA replication apparatus تحتوي أيضا على ميزات لا توجد في الكائنات الحية الأخرى، والتي ربما تكون نتيجة لمجموعة واسعة من الظروف البيئية environmental conditions التي تزدهر فيها أعضاء هذا المجال. سوف ندرس تضاعف DNA في إشيريشيا كولاي Escherichia coli، والذي تم دراسته بشكل أكثر شمولا من معظم الميكروبات الأخرى.
يتطلب تضاعف الكروموسوم Chromosome replication منتجات products أكثر من 20 جين genes، وعلى الرغم من أنه يحدث في عملية سلسة smooth process، إلا أنه يمكننا فصلها إلى ثلاث مراحل: البدء initiation عندما يتفكك DNA وينفصل الشريطين strands؛ الاستطالة elongation عندما تخلق الانزيمات enzymes شريط عديد النيوكليوتيد polynucleotide strand جديد من DNA لكل واحد من شريطي القالب القديمة template strands (الأبوية parental)، والإنهاء termination، عندما كل ينفصل حلزوني DNA عن بعضها البعض.
لوحظ هذا المزيج من شريط جديد وقديم لأول مرة في إي. كولاي في عام 1958 من قبل ماثيو جي ميسلسون Matthew J. Meselson وفرانكلين دبليو ستهل Franklin W. Stahl. يسمى التضاعف نصف المحافظ semi-conservative replication لأن كل شريط قديم من DNA المتضاعف يحفظ في كل كروموسوم جديد ويتم تخليق شريط واحد حديث.
1- البدء initiation
يبدأ تضاعف DNA في منطقة ثابتة fixed region على الكروموسوم تسمى أصل التضاعف replication origin (oriC)، والتي هي تسلسل حوالي 250 زوج قاعدي base pairs (الأزواج القاعدية: الاقتران التكميلي من A-T و G-C على شريطي عديد النيوكليوتيد المتقابلة). مجموعة من البروتينات البادئة initiator proteins ترتبط بالأصل بالإضافة إلى إنزيمات أخرى، تشكل مصنعي تضاعف replication factories سيحدث فيها تخليق DNA. إنزيمات الهيليكيز Helicases تحل وتفك الشريطين عديدة النيوكليوتيد، بينما تبقي البروتينات المثبتة stabilizing proteins شريطي القالب منفصلة لتضاعف الأشرطة المكملة complementary strands. لأنه يعتقد أن مصنعي التضاعف cell membrane تكون ملتصقة بالغشاء الخلوي cell membrane، تتحرك أشرطة القالب المتضاعفة عبر شوكة تضاعف على شكل حرف (V) V-shaped replication fork في كل مصنع.
2- الاستطالة elongation
تخليق DNA في كل مصنع يحدث عندئذ في كل شريط قديم، والذي يمثل قالب template لتخليق الشريط المكمل الجديد. تشارك العديد من البروتينات في تخليق DNA. بالإضافة إلى البروتين المثبتة، يتحرك إنزيم بلمرة DNA الثالث DNA polymerase III على امتداد كل شريط، يحفز إدخال نيوكليوتيدات مكملة complementary nucleotides جديدة إلى كل شريط قالب.
في إي. كولاي E. coli، يستغرق تخليق DNA حوالي 40 دقيقة، وهو ما يعني أنه في كل شوكة تضاعف يضيف إنزيم بلمرة DNA الثالث DNA polymerase III قواعد مكملة جديدة بمعدل حوالي 1000 قاعدة في الثانية! على هذه الوتيرة، تحدث أخطاء errors عندما يتم إضافة قاعدة غير صحيحة incorrect base. هذه الطفرات mutations المحتملة قد تكون مميتة، لذلك يجب أن تكون هناك آلية لتصحيح أي أخطاء (الطفرات: تعديلات دائمة في تسلسل قواعد DNA). تكشف إنزيمات بلمرة DNA الأول والثالث DNA polymerases III and I أي نيوكليوتيدات غير متطابقة، تزيل النيوكليوتيدة الغير صحيحة في الزوج، وتضيف النيوكليوتيدة الصحيحة. يقلل هذا التدقيق التصحيحي proofreading من أخطاء التضاعف replication errors إلى حوالي 1 في كل 10 مليار قاعدة مضافة.
3- الإنهاء termination
في حوالي 40 دقيقة، تتقابل شوكتي التضاعف 180 درجة من أصل التضاعف (oriC). في منطقة النهاية terminus region، هناك بروتينات منهية terminator proteins إضافية تمنع المزيد من التضاعف، مما يسبب تفكك مصنعي التضاعف. بعد ذلك، ينفصل جزيئي DNA المتشابكة intertwined DNA molecules (الكروموسومين chromosomes) عن طريق انزيمات أخرى، مما يضمن أن كل خلية بنوية daughter cell سترث كروموسوم واحد كامل بعد الانقسام الثنائي binary fission.

ليست هناك تعليقات:

إرسال تعليق